自然食品や自然派化粧品、生活雑貨などを販売するショップ。「ナチュラルハウス食品取扱基準」という基準を設定し、野菜・精肉・水産物・パン・卵・牛乳・砂糖・醤油・味噌・米・調味料など、出来る限り産地栽培方法が明確で主原料に遺伝子組み換え原料を使用していない食品を取り扱っている。有機食材も豊富。オリジナル自然派化粧品や体に優しい生活雑貨なども販売。

クレヨンハウス東京店（青山）の地下一階。併設のオーガニックレストラン「広場」の食料庫として1992年にオープン。有機栽培の野菜や果物・無添加の加工食品・調味料やお菓子・自然食配合で地飼いによる安全な食肉など、季節や旬を感じさせ、からだのリズムにもあった安全安心な食材を取り揃える。

原宿。ハンバーガーショップ「フレッシュネスバーガー」が展開する、新しいバーガーショップ。デリシャスでヘルシーな生活を意味する“デリシー・ライフ”をコンセプトに、オイルやパスタなどオーガニック輸入食材を始め、海外のナチュラル食材を200種以上を販売するスペースを備える。

シャネル、ブルガリなど高級ブランドが集積した商業施設「GYRE（ジャイル）」のB1Fにオープンしたオーガニック食材店「cinagro」。世界中から取り寄せたオーガニックフードや100種類のビオワインなどを取り揃えている。キッチンでは、有機野菜を使ったヘルシーな惣菜や玄米ご飯などのプレート、季節野菜のポタージュを中心としたスーププレートなど、ヘルシーなメニューが満載。

麻布十番。有機農産物、ナチュラルフードなどの宅配サービスとして草分け的な存在である「地球人倶楽部」のアンテナショップ。同社が提供する、エコロジカルでヘルシーな食品が豊富に並ぶ。食品の他にも、オーガニック化粧品やナチュラルな防虫剤など、エコ生活雑貨も豊富。店内は、土で塗られた壁などナチュラルな雰囲気が心地良い。

麻布十番。世界自然遺産「白神山地」のブナ原生林から発見された「白神こだま酵母」と、北海道産小麦、天然塩、国産キビ砂糖など厳選された素材で、ひとつひとつ丁寧に焼き上げた天然酵母パンが特徴のお店。北海道産小麦粉、国産キビ砂糖、自然塩など素材にもこだわっている。

白金高輪。ヘルシーなおから100％ケーキやクッキーを販売しておから1989年開店のケーキのお店「そ屋」。国産大豆の食物繊維が凝縮されたおから100％で焼き上げている。ケーキに使う材料は国内産の有機栽培野菜を使用、砂糖は三温糖、黒砂糖、塩は自然塩を使用するなど自然素材100％にこだわっている。

六本木。オーストリアウィーンに本店のある紅茶ブランド「デンメアティーハウス」。ウィーンより空輸された「ブラックティー」「フルーツティー」「フレーバードティー」「ハーヴァルティー」「グリーンティー」「ルイボスティー」などを取り揃えている。100%ナチュラルのオーガニック製品もあり。

広尾。お米マイスターもいる自然農法米、オーガニック米を扱うこだわりのお米屋さん。生産者の顔が見えるお米の量り売りコーナーもあり。お米の他にも自然食品やハーブ製品なども販売している。

赤坂。オーガニックデリショップ。オーガニックを身近な価格で提供する、をコンセプトに惣菜などを販売している。産物は有機栽培（有機JAS）、特別栽培のものを中心に使用し、水産物は天然のものを中心に使用し、養殖の場合は抗生物質の残留の疑いのあるものは扱わない。品質維持のため食材を定期的に自主検査を行なっている。