下北沢。有機野菜やオーガニックな生活雑貨を販売する御茶ノ水の「ガイア」の下北沢店。自然食品や生活雑貨などの物販と自然食が楽しめる飲食店が併設しているお店。日替り野菜コロッケ定食や日替り玄米のり巻き定食などガイアならではの自然食を提供している。

梅が丘駅。安心･美味しい自然食品、地球と人にやさしい日用品、自然化粧品などオーガニックライフをサポートしてくれる各種商品を販売している。農産物は無農薬・無化学肥料・無肥料栽培の旬の季節野菜を取り扱っている。その他、無農薬、無化学肥料、無肥料栽培のりんごジュース・にんじんジュースや、一番搾り蜂蜜など。オーガニックカフェレストランを併設。

世田谷・砧。「医食同源」「身土不二」をコンセプトに安心安全の自然食品や栄養補助食品、加工食品、飲料などを提供するお店。2000品目以上の品揃えを誇る。食品以外にも美容、美容・ベビー・暮らし・衣料品などのエコプロダクツも取り扱っている。

永福町。酒と自然食品の店。 生産者の顔が見える無農薬有機栽培野菜・果物、肉・魚・惣菜・牛乳・卵・天然酵母パン・調味料・菓子・雑貨・自然派化粧品などを取り揃えている。お酒は、日本の伝統を守り「本当の酒」を造り続けている地酒やオーガニックビールなど。２０坪のワインセラー＆冷蔵庫にて自然酒の保存・熟成を行っている。

世田谷・代田。巨大なスペイン式石窯で焼きあげる天然酵母パンのお店。天然酵母を使いゆっくり発酵させ、材料は全て安全な素材だけを使った無添加パン。

荻窪、吉祥寺、三鷹。約30年の歴史を持つ自然食品店。農薬を一切使わない国産の野菜や果物を低価格で販売している。加工品も基本的にすべて無添加なものを取り揃えている。店内にある60％の野菜は農家が直接、届けてくれる。会員制宅配サービスも提供している。

高円寺。店内には、自然農法産のお米・日本の伝統製法による調味料・オ－ガニック認定の食品・マクロビオティック食品などを厳選された自然食品が並ぶ。シャンプー・せっけん・洗剤などは材料が自然で合成添加物をなるべく含まないエコロジカルな商品を取り揃えている。店舗には、賞味期限が近かいなどを理由とした商品が多数アウトレット価格で販売されており、バーゲンプライスでお買い得。

荻窪。"自然のありのままのおいしさ"をコンセプトに、添加物などは一切使用せずに作られるベジフルスイーツが人気の店。セロリ・キャロットなどの野菜が主役のケーキ・焼き菓子はオリジナリティとフランス菓子の伝統が見事なバランスで融合されている。旬の野菜7種類ほどが毎日店頭に並ぶ。

西荻窪。無農薬野菜と玄米を使った自然食カフェ／レストラン「BALTHAZAR：バルタザール」。豆と旬の野菜料が豊富で、マクロビオティックな料理もあり。1Fでは無農薬野菜などの食材を販売している。

荻窪の自然派八百屋。有機農産物や、山梨県・白州町でとれるトマト・とうもろこし・なす・きゅうり・いなげん・白菜、また山梨県・芦川村でとれる刺身こんにゃくなど、店主が実際に足を運んで安全な食品のみを取り揃えるスローフード・パラダイスなお店。その他、自然派石鹸・洗剤やボディケア商品など日用品も取り扱っている。